L'Assemblea Autonòmica és el màxim òrgan del Sindicat en l'àmbit de la Comunitat Autònoma.
Es reuneix de manera ordinària com a mínim una vegada entre Congrés i Congrés, i les seves funcions són les mateixes que té el Congrés Estatal, excepte aquelles que excedeixin de l'àmbit autonòmic. Aquestas són:
Establir les línies bàsiques de política d'acció sindical, política d'organització i econòmica en l'autonomia.
Controlar les accions del Comitè executiu Autonòmic i restants òrgans autonòmics del Sindicat.
Elegir el o la Secretari o Secretària General Autonòmic.